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03/14/2017 16:00
Aula MAC, FACULTAD DE FARMACIA
Título del curso/taller: Secuencias proteicas: iniciación al análisis mediante programas bioinformáticos.
Profesorado:
Nombre: Dr. Raúl Rivas González
Departamento: Microbiología y Genética
Correo electrónico: raulrg@usal.es
Nombre: José David Flores Félix
Correo electrónico: jdflores@usal.es
Datos de la Actividad:
Duración: 2 horas
Días: 14 de Marzo 2017
Horario: 16:00-18:00 horas
Lugar: Sala MAC. Facultad de Farmacia
Nº de Plazas: 15
Enfocado a: Alumnos de los grados de Farmacia, Biología, Ciencias Ambientales, Química, Biotecnología y otras titulaciones de ciencias, así como personal investigador en formación, investigadores, personal técnico y docentes interesados en la materia, que no tengan ningún conocimiento en bioinformática y que deseen adquirir conceptos y aprender herramientas básicas relacionadas.
Conocimientos previos: Conocimientos de informática a nivel de usuario (Internet, e-mail, MS Word…). Es deseable, pero no imprescindible haber participado en el curso anterior sobre análisis de secuencias de ADN.
Objetivos:
-Adquisición de conocimientos en conceptos básicos para el análisis bioinformático de proteínas.
-Manejar las distintas herramientas bioinformáticas disponibles, software y online.
-Búsqueda en bases de datos públicas.
Contenidos:
- Introducción a la bioinformática. Ventajas de trabajar con secuencias proteicas respecto a las nucleotídicas.
- Formatos de secuencias proteicas.
- Bases de datos. Comparación de secuencias.
- Alineamiento múltiple de secuencias proteicas.
- Predicción de dominios proteicos.
- Modelización y predicción de estructura proteica.
- Ejemplos prácticos.
Metodología/Programación:
16:00 h - Introducción a la bioinformática. Ventajas de trabajar con secuencias proteicas respecto a trabajar con secuencias nucleotídicas.
16:15 Formatos de secuencias proteicas. Conversión de secuencias nucleotídicas a proteicas.
16:30 Bases de datos. Comparación de secuencias. Introducción a BLAST. Ejemplos prácticos.
17:00 Alineamiento múltiple de secuencias proteicas. Programas de alineamiento múltiple. Uso práctico.
17:20 Predicción de dominios proteicos. Uso práctico de programas online de predicción de dominios.
17:40 Modelización y predicción de estructura proteica. Ejercicio de modelización de una secuencia proteica.
Programas/Utilidades necesarias:
Todos los programas utilizados son gratuitos y están disponibles online.
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Jan
31st
'17
09:30 Registration opens
Mar
12th
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14th
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18:00 Closing date
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