Secuencias proteicas: iniciación al análisis mediante programas bioinformáticos.

About the event

03/14/2017 16:00

Aula MAC, FACULTAD DE FARMACIA

Categories:: Biomedical diagnostics; Learning and teaching health; Medical research; Pharmacy

Keywords:: bioinformática; Educafarma 5.0; farmacia; Investigación; Secuencias proteicas

Título del curso/taller: Secuencias proteicas: iniciación al análisis mediante programas bioinformáticos.

  

 Profesorado:

           Nombre: Dr. Raúl Rivas González

           Departamento: Microbiología y Genética

           Correo electrónico: raulrg@usal.es

           

           Nombre: José David Flores Félix

           Departamento: Microbiología y Genética

           Correo electrónico: jdflores@usal.es

  

 Datos de la Actividad:

           Duración: 2 horas

           Días: 14 de Marzo 2017 

           Horario: 16:00-18:00 horas

           Lugar: Sala MAC. Facultad de Farmacia

           Nº de Plazas: 15

  

 Enfocado a: Alumnos de los grados de Farmacia, Biología, Ciencias Ambientales, Química, Biotecnología y otras titulaciones de ciencias, así como personal investigador en formación, investigadores, personal técnico y docentes interesados en la materia, que no tengan ningún conocimiento en bioinformática y que deseen adquirir conceptos y aprender herramientas básicas relacionadas.

  

 Conocimientos previos: Conocimientos de informática a nivel de usuario (Internet, e-mail, MS Word…). Es deseable, pero no imprescindible haber participado en el curso anterior sobre análisis de secuencias de ADN.

  

 Objetivos: 

 -Adquisición de conocimientos en conceptos básicos para el análisis bioinformático de proteínas.

 -Manejar las distintas herramientas bioinformáticas disponibles, software y online.

 -Búsqueda en bases de datos públicas.

  

 Contenidos:

 - Introducción a la bioinformática. Ventajas de trabajar con secuencias proteicas respecto a las nucleotídicas.

 - Formatos de secuencias proteicas.

 - Bases de datos. Comparación de secuencias.

 - Alineamiento múltiple de secuencias proteicas.

 - Predicción de dominios proteicos.

 - Modelización y predicción de estructura proteica.

 - Ejemplos prácticos.

  

 Metodología/Programación:

 16:00 h - Introducción a la bioinformática. Ventajas de trabajar con secuencias proteicas respecto a trabajar con secuencias nucleotídicas.

 16:15 Formatos de secuencias proteicas. Conversión de secuencias nucleotídicas a proteicas.

 16:30 Bases de datos. Comparación de secuencias. Introducción a BLAST. Ejemplos prácticos.

 17:00 Alineamiento múltiple de secuencias proteicas. Programas de alineamiento múltiple. Uso práctico.

 17:20 Predicción de dominios proteicos. Uso práctico de programas online de predicción de dominios.

 17:40 Modelización y predicción de estructura proteica. Ejercicio de modelización de una secuencia proteica.

  

 Programas/Utilidades necesarias:

  

 Todos los programas utilizados son gratuitos y están disponibles online.

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